از آنجایی که تبیین و ترویج احکام و معارف اسلامی در سرلوحه ی برنامه های کاری مدرسه صادقیه از آغازین لحظات تاسیس تاکنون قرار داشته و دارد، بنابراین رسیدگی و ساماندهی به امور مساجد و تکایا و نیز ساخت و ساز و اعمار این بناهای دینی – مذهبی، که همواره در شمار اصلی ترین مکان های تبلیغ و بیان احکام و معارف دین مقدس اسلام می باشد، و در حقیقت سنگر اسلام است، از جمله ی مهمترین اهداف و فعالیت های مدرسه بوده است.
با کمک این بخش فعالیت و تلاش های بسیار زیادی از همان ابتدای تاسیس مدرسه یعنی از سال 1345 هـ ش در راستای برنامه ریزی دقیق و مفید برای مساجد و تکایای شهر هرات و حومه ی آن و نیز ساختن مساجد و تکیه خانه ها در مناطق محروم و مورد نیاز شهر صورت پذیرفته است که بسیاری از مساجد و تکایای شهر هرات حاصل همین تلاش های صادقانه و دلسوزانه مسئولین و گردانندگان این مدرسه می باشد.
در قسمت اعمار و ساخت مساجد، این بخش ابتدا به شناسایی مناطق محروم پرداخته و بررسی می نماید که در چه مناطقی نیاز به اعمار مسجد می باشد. سپس با همکاری مردم منطقه اقدام به ساخت مسجد در آنجا می نماید، که بخش بسیار بزرگی از مساجد و حسینیه های شهر و روستا در هرات از همین طریق ایجاد و اعمار شده است و ذکر نام آنها در حوصله این مقال نمی گنجد .
در کنار اعمار و ساخت مساجد در نقاط مورد نیاز، این بخش مدرسه در ترمیم و بازسازی دهها مسجد و تکیه خانه دیگر نیز همکاری نموده و می نماید.
از دیگر برنامه های این بخش تقویت بنیه ی علمی امامان و وعاظ مساجد و تکایا از طریق راه اندازی کلاس ها و دوره های آموزشی می باشد که هر چند وقت یکبار برگزار می شود.
هماهنگی و تنظیم برنامه های تبلیغی در ایام محرم و صفر و ماه مبارک رمضان در مساجد و تکایا از طریق نشست بین هیئت امنای مساجد و تکایای شهر و اطراف آن و نیز اعزام امام جماعت و واعظ به مساجد و تکایایی که نیاز به امام جماعت یا واعظ و منبری دارند، نیز از دیگر کارهای این بخش مدرسه می باشد.
در آشفته بازار فرهنگی که از هر سوی مردم مسلمان ما مورد هجوم انواع فرهنگ های بیگانه و مبتذل قرار گرفته اند، مدرسه صادقیه می کوشد نسل جوان و نوجوان و خردسال را اعم از دختر و پسر با آیین ناب اسلامی آشنا کرده و با این آشنایی آنها را از خطر گرفتاری در دام ابتذال و بی هویتی نجات بخشد .
مدرسه علمیه صادقیه